院共设办公室、经营科、总工办、计算机中心四个职能管理部门。具体职能如下：

　　办公室：负责院务工作的协调和对外联络、接待工作；负责重要会议的组织与记录，草拟重要文稿；负责文书处理文件印发、党政印章管理、文档管理、机要保密工作；负责固定资产管理工作；负责后勤服务管理和安全保卫工作；负责全院干部档案管理工作；负责人事调配管理、本源劳动工资、劳动就业保险工作；负责各类专业技术职称改革和评聘工作；负责全院财务管理、经费收支；编制年度财务预算、决算；负责经济技术核算、成本核算、编制财务报表；负责内部审计、物价、税收、固有资产管理工作。

　　经营科：负责全院的生产经营；组织政府机关下达的指令性规划勘测设计任务的实施；承接委托性工程勘察设计和规划编制项目；编制年度（季度）生产计划、下达生产任务；签订设计合同、技术合作协议；核定设计收费标准；负责生产运行管理，编制生产统计报表；负责设计成果的发送和归档。

　　总工办：负责院技术委员会日常工作；编制院技术发展规划；组织职工继续教育培训；组织科技成果及学术论文、优秀设计的鉴定、评审和推荐申报工作；负责资质的申报及管理工作。

　　计算机中心：负责全院计算机配发、管理及终端维护工作；负责设计成果出图工作。

　　院设有规划一室、规划二室、市政设计室、工程测绘科、基础测绘科、地理信息中心、建筑设计室、工程地质科、规划咨询部、城市设计研究室等10个业务科室。具体职能如下：

　　规划一室：负责编制和修订城市总体规划、分区规划、控制性详细规划、修建性详细规划。

　　规划二室：负责编制市政建设、园林绿化、市容环卫、供水节水、燃气、公共场站的中长期发展规划、承担城市公园、城市广场、街景绿化、市政道路、庭院绿化和区域性的地貌景观规划设计等。

　　市政设计室：编制和修订市政基础设施专业规划（包括城市给水排水、道路交通、电力电讯等）；承接上述各专业及室内给排水工程设计；开展城市基础设施项目可行性研究及城市道路交通发展研究。

　　工程测绘科的主要业务是负责工程放验线、竣工测量、变形测量、管线探测、小面积零星地形测绘、条带地形图测绘等业务工作。

　　基础测绘科的主要业务是负责等级控制测量、基本比例尺地形图的测绘与更新、大面积工程用地地形测绘等业务工作。

　　地理信息中心的主要业务是负责我市基础测绘地形图的建库、更新与成果管理，负责城市规划区综合地下管线的普查和数据库的建设，为“数字荆门”地理空间框架建设提供技术支撑，为政府及其各部门信息化提供现实性强，公共的、统一的、权威的规划测绘信息集成平台，推动规划测绘信息共享和数据资源的充分利用。

　　建筑设计室：负责承接工业与民用建筑、构筑物的方案设计和施工图设计。

　　工程地质科：负责承接建筑工程地质勘探业务，作出有关工程地质方面的评估和综合论证。

　　规划咨询部：承担规划主管部门和业主委托的建设用地、管线工程规划的论证咨询及建筑工程规划报建方案咨询。

　　城市设计研究室的主要业务是在城市总体规划、分区规划、控规及各专业规划的指导下，负责城市主要路段、街道、风景区等的街景、建筑方案、环境及配套设施、包括城市雕塑、园林建筑等的设计，负责城市规划、城市设计等有关课题的研究等。

　　现持有城乡规划编制甲级、市政行业（道路工程）专业甲级、测绘甲级、工程勘察（岩土工程勘察）甲级四个甲级资质，同时还拥有市政行业（桥梁工程、排水工程、给水工程）和建筑工程乙级资质。2006年通过ISO9001质量体系认证，2017年被国家科技部认定为高新技术企业。